如果排除了污染，細胞培養基中的渾濁通常被解釋為金屬、蛋白和其他培養基組分的沉淀。沉淀物可能損害細胞健康，因為它們通過螯合可移除養分和其他需要的組分，從而改變培養基的組成。沉淀物也是顯微鏡可見的，可能會干擾依賴成像的實驗分析。

　　產生沉淀的可能原因

　　一、溫度變化

　　在細胞培養中，溫度是引起沉淀的主要因素之一。當遭遇溫度的變化時，高分子量血漿蛋白會從溶液中析出；熱失活和凍融循環能促進蛋白降解和沉淀；因為液體或重組成培養基在使用之間保持冷藏儲存，鹽可能沉淀，尤其是10x或其他濃縮的儲存液。

　　二、失水誘導的濃度改變

　　如果培養基可能蒸發，培養基組分(包括鹽) 的濃度將會增加，特別是培養基表面可能容易形成晶體沉淀。

　　三、鈣鹽

　　制備無血清培養基時，組分添加的順序可能導致不可溶分子的形成。鈣鹽尤其容易沉淀，比如CaCl2和MgSO4在溶液中反應產生CaSO4晶體。高壓滅菌和pH值不穩定會加劇這一問題。

　　四、金屬補充物

　　銅、鐵和鋅等金屬離子是細胞生長所必需的，是無血清培養基的重要補充物。培養系統中其他血清組分的缺失可能導致這些金屬沉淀，為細胞形成有毒的環境。在較高pH環境下(一般>8時)，碳酸鹽和氫氧根離子與銅離子、磷酸鹽和氫氧根離子與鐵離子、碳酸鹽、磷酸鹽和氫氧根離子與鋅離子、氫氧根離子與鎂離子易形成不溶性沉淀物；在氧化條件下，銅和鋅更易于沉淀。